Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLHL22Q53GT1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms