Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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USP41Q3LFD5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP41Q3LFD5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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