Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCAQ16586 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCAQ16586 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms