Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDCD2Q16342 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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