Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ARHGEF6Q15052 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
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ARHGEF6Q15052 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ARHGEF6Q15052 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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