Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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