Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA1SQ13698 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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