Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR1H3Q13133 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR1H3Q13133 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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NR1H3Q13133 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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NR1H3Q13133 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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NR1H3Q13133 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NR1H3Q13133 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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