Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms