Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRKCDQ05655 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRKCDQ05655 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms