Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHRNEQ04844 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms