Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUD4Q01804 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms