Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DEFA6Q01524 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DEFA6Q01524 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms