Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTA1P68133 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTA1P68133 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTA1P68133 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms