Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTC1P68032 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTC1P68032 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTC1P68032 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms