Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COPZ1P61923 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPZ1P61923 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms