Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PBX1-203ENST00000420696 6636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
TMEM258P61165 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms