Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDC42P60953 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDC42P60953 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDC42P60953 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms