Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMA6P60900 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PSMA6P60900 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PSMA6P60900 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PSMA6P60900 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms