Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMARCA4P51532 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMARCA4P51532 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms