Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMAN1P49257 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMAN1P49257 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms