Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH9A1P49189 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH9A1P49189 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH9A1P49189 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms