Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
APOBEC1P41238 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms