Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5C1P36542 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms