Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJC1P36383 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJC1P36383 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJC1P36383 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJC1P36383 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms