Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.066e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.026e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TKT-214ENST00000494523 1955 ntTSL 214.91□□□□□ -0.026e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TKT-207ENST00000461139 1972 ntTSL 214.78□□□□□ -0.046e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.166e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TJP2-210ENST00000606364 591 ntTSL 413.88□□□□□ -0.196e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.256e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.36e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 213.18□□□□□ -0.36e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.066e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 GXYLT2-202ENST00000491839 494 ntTSL 38.36□□□□□ -1.076e-6■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.016e-8■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.956e-8■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 DUT-204ENST00000558472 724 ntTSL 320.04■□□□□ 0.86e-8■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 DUT-206ENST00000558978 1171 ntTSL 319.98■□□□□ 0.796e-8■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.546e-8■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.066e-8■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC13.98□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 320.99■□□□□ 0.953e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 319.14■□□□□ 0.653e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 218.78■□□□□ 0.63e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 518.3■□□□□ 0.523e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.043e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 515.17■□□□□ 0.023e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.113e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.193e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 513.67□□□□□ -0.223e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 313.56□□□□□ -0.243e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-21■■□□□ 12.4
GTF2F1P35269 TERF2-209ENST00000569280 513 ntTSL 510.36□□□□□ -0.752e-8■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.984e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.764e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.734e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 325.24■■□□□ 1.634e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 PCNX3-205ENST00000531280 472 ntTSL 518.02■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 PCNX3-202ENST00000439247 3104 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.23e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.798e-66■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.536e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-206ENST00000565849 639 ntTSL 329.8■■■□□ 2.366e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-213ENST00000569573 849 ntTSL 329.15■■■□□ 2.266e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.639e-7■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-210ENST00000568485 707 ntTSL 225.14■■□□□ 1.626e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 FARP1-231ENST00000600648 433 ntTSL 524.33■■□□□ 1.496e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-220ENST00000451686 501 ntTSL 424.17■■□□□ 1.466e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.169e-7■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-224ENST00000470742 474 ntTSL 422.3■■□□□ 1.166e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 CARD10-210ENST00000494166 560 ntTSL 521.99■■□□□ 1.116e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 COL27A1-205ENST00000485397 463 ntTSL 521.86■■□□□ 1.096e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-219ENST00000444491 827 ntTSL 420.49■□□□□ 0.876e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-202ENST00000561904 897 ntTSL 320.19■□□□□ 0.826e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-208ENST00000567007 2615 ntTSL 219.7■□□□□ 0.746e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.76e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.636e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.626e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.616e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.446e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.46e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.366e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.336e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.296e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-207ENST00000566368 438 ntTSL 316.4■□□□□ 0.226e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AGAP4-202ENST00000430779 952 ntTSL 216.26■□□□□ 0.196e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 FAM168A-205ENST00000632101 473 ntTSL 215.75■□□□□ 0.116e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.026e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-204ENST00000564718 688 ntTSL 314.21□□□□□ -0.136e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 313.35□□□□□ -0.276e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.286e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ASTN2-203ENST00000341734 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.36e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-212ENST00000568839 944 ntTSL 312.78□□□□□ -0.366e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 SOX5-204ENST00000441133 638 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.376e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.426e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 E2F4-203ENST00000563238 736 ntTSL 212.37□□□□□ -0.436e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 412.16□□□□□ -0.466e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ASTN2-207ENST00000373986 3812 ntAPPRIS ALT2 TSL 211.94□□□□□ -0.56e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AK3-204ENST00000611749 4029 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.549e-7■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.739e-7■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 SOX5-213ENST00000541847 758 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.766e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.786e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AC016831.1-202ENST00000447307 726 ntTSL 38.7□□□□□ -1.026e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.056e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.146e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 AC016831.1-203ENST00000418546 578 ntTSL 47.37□□□□□ -1.236e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.696e-6■■□□□ 12.3
GTF2F1P35269 SLC16A3-210ENST00000580189 872 ntTSL 520.74■□□□□ 0.911e-11■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.82e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 INPP5B-203ENST00000373024 3060 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 INPP5B-206ENST00000458109 3979 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)28.61■■■□□ 2.173e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 DYRK1A-209ENST00000608928 483 ntTSL 524.44■■□□□ 1.53e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 DYRK1A-206ENST00000455097 338 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.623e-6■■□□□ 12.2
GTF2F1P35269 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.133e-6■■□□□ 12.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 337 ms