Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP1P29466 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP1P29466 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP1P29466 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms