Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POLD1P28340 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POLD1P28340 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POLD1P28340 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms