Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL6A2P12110 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms