Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
U2AF1L5P0DN76 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms