Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CTDSP2O14595 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CTDSP2O14595 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CTDSP2O14595 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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