Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
EBAG9O00559 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EBAG9O00559 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms