Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USP18Q9UMW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP18Q9UMW8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP18Q9UMW8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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USP18Q9UMW8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USP18Q9UMW8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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