Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHORDC1Q9UHD1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms