Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP35Q9P2H5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms