Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRBP1Q9P2E9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms