Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLAIN2Q9P270 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAIN2Q9P270 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms