Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHL28Q9NXS3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms