Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PCDHB16Q9NRJ7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCDHB16Q9NRJ7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCDHB16Q9NRJ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCDHB16Q9NRJ7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PCDHB16Q9NRJ7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PCDHB16Q9NRJ7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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