Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLSPNQ9HAW4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms