Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms