Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRIM55Q9BYV6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms