Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf16Q9BUW7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms