Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NSMCE2Q96MF7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms