Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CAVIN3Q969G5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms