Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMARCE1Q969G3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMARCE1Q969G3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms