Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRUQ92729 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRUQ92729 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms