Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 39.2
DGCR8Q8WYQ5 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 58.71□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 39.2
DGCR8Q8WYQ5 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 54.92□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 39.2
DGCR8Q8WYQ5 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 54.69□□□□□ -1.661e-7■■■■■ 39.2
DGCR8Q8WYQ5 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 53.75□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 39.2
DGCR8Q8WYQ5 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-13■■■■■ 39.2
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DGCR8Q8WYQ5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.43e-10■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.263e-10■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 JRK-201ENST00000503272 587 ntTSL 415.01□□□□□ -0.013e-10■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.287e-10■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-210ENST00000569662 572 ntTSL 419.89■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-206ENST00000466978 861 ntTSL 319.44■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 39.1
DGCR8Q8WYQ5 BRD2-216ENST00000581002 550 ntTSL 418.2■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.192e-8■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 39
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DGCR8Q8WYQ5 MFSD6-206ENST00000434582 2902 ntTSL 59.72□□□□□ -0.857e-7■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.31e-6■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 39
DGCR8Q8WYQ5 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 38.9
DGCR8Q8WYQ5 ABCC3-203ENST00000502426 5326 ntTSL 213.27□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 38.9
DGCR8Q8WYQ5 ABCC3-207ENST00000505699 5271 ntTSL 212.75□□□□□ -0.375e-7■■■■■ 38.9
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 38.8
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 38.8
DGCR8Q8WYQ5 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 38.8
DGCR8Q8WYQ5 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC10.02□□□□□ -0.816e-12■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 ITGA2-203ENST00000509814 3487 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 MPHOSPH8-201ENST00000361479 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.641e-12■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 ITGA2-206ENST00000513685 3501 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 ITGA2-204ENST00000509960 3674 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 ITGA2-205ENST00000510722 3530 ntTSL 1 (best)10.28□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 ITGA2-202ENST00000503810 3782 ntTSL 59.6□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 MYO7A-211ENST00000620575 4016 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 MYO7A-203ENST00000409893 4050 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 GRAMD1B-213ENST00000633646 847 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.657e-10■■■■■ 38.7
DGCR8Q8WYQ5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.383e-6■■■■■ 38.6
DGCR8Q8WYQ5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 38.6
DGCR8Q8WYQ5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 38.6
DGCR8Q8WYQ5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.394e-11■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)22.35■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 519.31■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-7■■■■■ 38.5
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DGCR8Q8WYQ5 VIL1-202ENST00000392114 1968 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 VIL1-205ENST00000454069 532 ntTSL 39.3□□□□□ -0.922e-10■■■■■ 38.5
DGCR8Q8WYQ5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 38.4
DGCR8Q8WYQ5 BDP1-204ENST00000508917 7194 ntTSL 1 (best)13.12□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 38.4
DGCR8Q8WYQ5 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 38.4
DGCR8Q8WYQ5 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 38.4
DGCR8Q8WYQ5 LINC01138-207ENST00000638958 1395 ntTSL 515.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 38.4
DGCR8Q8WYQ5 LINC01138-210ENST00000640832 1709 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 38.4
DGCR8Q8WYQ5 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.089e-7■■■■■ 38.3
DGCR8Q8WYQ5 ARGLU1-201ENST00000360629 361 ntTSL 22.75□□□□□ -1.979e-7■■■■■ 38.3
DGCR8Q8WYQ5 SH3BP5-207ENST00000450625 763 ntTSL 314.88□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 38.3
DGCR8Q8WYQ5 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.83e-11■■■■■ 38.3
DGCR8Q8WYQ5 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 24.59□□□□□ -1.675e-11■■■■■ 38.3
DGCR8Q8WYQ5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 38.3
DGCR8Q8WYQ5 LRMDA-209ENST00000593699 1124 ntTSL 1 (best)10.27□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 38.2
DGCR8Q8WYQ5 FOSL2-203ENST00000436647 889 ntTSL 212.26□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-220ENST00000637386 621 ntTSL 521.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 218.66■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-208ENST00000538144 1805 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-222ENST00000637624 4132 ntTSL 213.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-202ENST00000267257 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 PXN-206ENST00000458477 3807 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91e-8■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 38.1
DGCR8Q8WYQ5 CYP11A1-203ENST00000416978 566 ntTSL 415.02■□□□□ -08e-7■■■■■ 38
DGCR8Q8WYQ5 SORBS2-235ENST00000451974 873 ntTSL 59.6□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 37.8
DGCR8Q8WYQ5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 37.8
DGCR8Q8WYQ5 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 37.8
DGCR8Q8WYQ5 MEG3-226ENST00000556407 632 ntTSL 412.12□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 37.8
DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 37.8
DGCR8Q8WYQ5 LIMCH1-205ENST00000503057 5467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 37.8
DGCR8Q8WYQ5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 37.7
DGCR8Q8WYQ5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 37.7
DGCR8Q8WYQ5 KNDC1-205ENST00000530127 643 ntTSL 315.97■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 37.6
DGCR8Q8WYQ5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 37.5
DGCR8Q8WYQ5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 37.5
DGCR8Q8WYQ5 TRAPPC12-206ENST00000417243 1047 ntTSL 512.62□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 37.5
DGCR8Q8WYQ5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 37.5
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