Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ZNRF4Q8WWF5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNRF4Q8WWF5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms