Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GIPC3Q8TF64 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms